Dámaso Flecha Morán se encontraba en su localidad de residencia cuando se produjo el golpe de Estado. En septiembre de 1936 se pasó a la retaguardia republicana en calidad de refugiado. Tras la caída del Frente Norte asturleonés fue detenido y sometido a un juicio sumarísimo en el que fue condenado a doce años y un día de prisión. Estuvo internado en la Prisión Militar de San Marcos. Estuvo internado en 1938 en la Prisión Provincial de León y la Prisión Militar de San Marcos, donde permaneció encarcelado hasta el 20 de septiembre. Dicho año fue trasladado a la Prisión Central de Astorga, donde estuvo preso hasta 1943. 

El 31 de octubre de 1938 la Comisión Provincial de Incautación de Bienes de León incoó contra él un expediente de responsabilidades civiles que quedó inconcluso. Con la promulgación de la Ley de Responsabilidades Políticas de 1939 fue retomado por el Tribunal Regional de Responsabilidades Políticas de Valladolid, pero también quedó inconcluso.